Software de análise microscópica de células otimiza trabalho no laboratório de pesquisa

Em meados de 2008, eu e um colega da TI do hospital começamos a criar um projeto que visava a identificação de estruturas celulares do sangue por meio de um software que “conhecia” as estruturas e as comparava com a encontrada pelo microscópio, mas esbaramos logo no início na questão financeira. Mas, muito melhor, pesquisadores da European Molecular Biology Laboratory (EMBL) em Heidelberg, Alemanha, desenvolveram um software de análise morfológica que diminui o tempo da demorada tarefa de microscopia laboratorial.

Microscopia quantitativa em pesquisas baseia-se na imagem de grande número de células, mas é muitas vezes dificultada pela demorada seleção manual de células específicas, apresentado recentemente na revista Nature Methods, um programa de computador pode rapidamente aprender o que o cientista está procurando e, em seguida, assume esta tarefa laboriosa e demorada, automaticamente realizando experimentos de microscopia complexa quando se detecta células com características interessantes.

O software, chamado Micropilot, identifica as características das células que os pesquisadores laboratoristas estão procurando e a partir destes dados ele faz uma varredura completa buscando encontras outras células com as mesmas conformações estruturais.

Ele analisa imagens de baixa resolução tomada por um microscópio e, uma vez que identificou uma célula ou estrutura que a equipe do laboratório indicou, inicia a busca, desta forma ocorre uma redução impressionante do tempo de busca, enquanto o software em 4 dias encontra por volta de 200 células o microscopista experiente levaria mais de um mês para fazer a mesma avaliação, um ganho de tempo que possibilita chegar a resultados de pesquisa muito mais rápido e reduzindo também gastos.

O software Micropilot está disponível como código-fonte aberto (zip) (código fonte do software, documentação, scripts e imagens de microscópio de demonstração).